Como eu penso que essa questão se resolve, de acordo com a metafísica tomista:
- O mal físico é a carência de uma perfeição em um bem contingente que corresponda à sua essência, ou que o impeça de alcançar o seu fim. Deus é Autor de todo bem, mas não do mal físico em si mesmo, que surge “per accidens” (por acidente), e é permitido por Deus em vista de um bem maior (por exemplo: como haveria a glória e a paciência dos mártires sem a maldade dos perseguidores?).